Sono trascorsi quasi cento anni dalla sconfitta della Strega Artemisia. Alla sua caduta è seguito un luogo periodo di pace e prosperità. Da compagnia di ventura, i Seed si sono trasformati in un corpo diplomatico. A seguito dell'abolizione degli eserciti nazionali, spetta ai Garden difendere la popolazione dai mostri. La rivoluzione tecnologica ha convertito le sorgenti magiche in fonti di energia industruale. La corsa, da parte di governi e compagnie private, ai giacimenti vergini ha dato un grande impulso alla crescita economica. Dalle rovine dell'orfanatrofio del capo di Buona Speranza, è stato fondato l'istituto Kramen, dove le potenziali streghe vengono accolte e monitorate. Grazie alla Lunatic Pandora, gli scienziati di Esthar riescono ad anticipare i pianti lunari, deviandoli verso zone disabitate. Una minaccia incombe però all'orizzonte, minacciando l'equilibrio del mondo. Gli eroi del passato non ci sono più, ma una nuova generazione di guerrieri sorge per prenderne il posto. Si dimostreranno all'altezza del compito?

Io sono Natsuno Koide?
A essere sincero, non lo so più.
Mentre divenivo ciò che sono, ho fatto un sogno.
Avrei aiutato il dottor Ozaki a sconfiggere gli Okiagari.
Avrei liberato Toru dal suo tormento.
Mi sarei scontrato contro Tatsumi e sarei perito assieme a lui.
Avrei salvato il villaggio.
Avrei tratto in salvo Akira e Kaori.
Come ho detto, era soltanto un sogno.