Non appena iniziate le vacanze di Natale, le famiglie dei Digiprescelti decidono di incontrarsi per una rimpatriata. Tutto sembra perfetto come sempre, fino a quando però i loro digimon cadono improvvisamente ed inspiegabilmente in uno stato di freeze che poi li porta a svanire. 
Grazie alla sua abilità con il computer, Izzy riesce a salvare i partner dei loro figli, così i bambini decidono di andare nel mondo digitale per capire cosa è successo e portare nuovamente sulla Terra tutti i Data e i Vaccini. Sfortunatamente scopriranno che le forze oscure a Digiworld sono più forti che mai e che questa volta restare uniti sarà la parte più difficile del combattimento ed al contempo la più importante.