Quando un misterioso personaggio riunisce i più grandi criminali del mondo Pokemon i protagoinisti dei vari giochi si dovranno riunire per sventare una grave minaccia. Ma dietro c'è un segreto, legato ad un dono che Arceus ha fatto all'umanità

Mario è un ragazzo timido e gracile, il cui sogno è allenare Pokemon Lotta per compensare la debolezza. Grazie ad un invenzione del professor Oak, il Pokèdex, parte insieme ad i suoi amici per affrontare la Lega incontrando organizzazioni criminali durante il viaggio. Come dite? é la solita storia? no stavolta è diverso, la Lega non è quella che conoscete