Sembra un giorno come tanti a Weiswolf, quando un singolo evento, apparentemente banale e senza importanza, darà via a un bagno di sangue di inaudite proporzioni. I sopravvissuti dovranno darsi da fare per fuggire dall'incubo...

2018: la morte di Shirley è stato un colpo troppo duro per Lelouch, che è impazzito completamente. Egli non ha attuato lo Zero Requiem, ha fatto giustiziare i suoi ex seguaci e ha eliminato anche Suzaku. Avendo rubato il code dell'immortalità al padre egli si è auto-incoronato imperatore eterno del mondo. 9 anni dopo, nel 2027, egli regna incontrastato sulla Terra, dopo aver liquidato i suoi nemici e schiavizzato la popolazione mondiale tramite il geass. A Parigi Leila Breisgau è costretta a nascondersi dalle autorità. In Giappone Cornelia, Guilford e Villetta (ormai divenuta folle dopo aver perso il suo amato e il bambino che portava in grembo) vivono in una cascina diroccata. Intanto, in Sud America, CC è sulle tracce di un misterioso soggetto M....

Leila, dopo il suo discorso televisivo ai cittadini di Europia, si rende conto che il popolo la venera alla stregua di una divinità. La ragazza, inebriata dalla sete di potere, si auto-incorona imperatrice, instaurando una monarchia assoluta. Ayano, un tempo sua amica, dovrà detronizzarla per mettere fine alla sua tirannia sanguinaria.